深圳市管理咨询行业协会的最高权力机构是会员大会，通过会员大会选举出会长、执行会长、常务副会长、副会长、理事、监事长、监事、秘书长，会员大会每届4年。理事会是会员大会的执行机构，在闭会期间领导本协会开展日常工作，对会员大会负责，理事会每半年至少召开一次会议。协会设立常务理事会，常务理事会由理事会选举产生，至少三个月召开一次会议。下设协会秘书处、专业委员会和产业咨询学社，采用金字塔模式发展协会会员，按照国家有关规定收取会员会费，并在发展过程中，逐步优化会员结构，促进企业会员、大学理事（关键力量）和专业委员会会员协同发展。

在运营层面，协会致力于打造中国管理咨询行业“深圳样板”，编制特色服务范例，再以滚雪球模式将“深圳样板”优势向粤港澳大湾区和全国扩展。

协会每年还会重点打造深圳商业基因研究工程、深圳市级管理咨询案例评选、深圳管理专家学院、商业连锁企业及各类管理咨询高峰论坛与研讨会等重点项目。逐步构建具有洞见、专业特色的管理咨询行业服务标准、专业能力规范，推动政企联动，做好政府与企业之间的“桥梁”。